MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2 chromosome

Total Repeats: 33858

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010830	AATT	2	8	529	536	50 %	50 %	0 %	0 %	189501471
2	NC_010830	AAC	2	6	540	545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189501471
3	NC_010830	A	6	6	615	620	100 %	0 %	0 %	0 %	189501471
4	NC_010830	T	7	7	660	666	0 %	100 %	0 %	0 %	189501471
5	NC_010830	AGA	2	6	677	682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189501471
6	NC_010830	TTA	2	6	696	701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501471
7	NC_010830	TAA	2	6	709	714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501471
8	NC_010830	TAT	2	6	752	757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501471
9	NC_010830	ATA	2	6	832	837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501471
10	NC_010830	CA	3	6	862	867	50 %	0 %	0 %	50 %	189501471
11	NC_010830	TCA	2	6	899	904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501471
12	NC_010830	CTG	2	6	976	981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501471
13	NC_010830	CAA	2	6	1007	1012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189501471
14	NC_010830	TGT	2	6	1030	1035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189501471
15	NC_010830	CTT	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501471
16	NC_010830	AC	3	6	1191	1196	50 %	0 %	0 %	50 %	189501471
17	NC_010830	TTTA	2	8	1198	1205	25 %	75 %	0 %	0 %	189501471
18	NC_010830	GAT	2	6	1227	1232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501471
19	NC_010830	TAG	2	6	1243	1248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501471
20	NC_010830	A	6	6	1255	1260	100 %	0 %	0 %	0 %	189501471
21	NC_010830	T	6	6	1272	1277	0 %	100 %	0 %	0 %	189501471
22	NC_010830	CAAA	2	8	1307	1314	75 %	0 %	0 %	25 %	189501471
23	NC_010830	TGA	2	6	1318	1323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501471
24	NC_010830	CAC	2	6	1336	1341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189501471
25	NC_010830	AAGA	2	8	1360	1367	75 %	0 %	25 %	0 %	189501471
26	NC_010830	CT	3	6	1371	1376	0 %	50 %	0 %	50 %	189501471
27	NC_010830	GCA	2	6	1406	1411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501471
28	NC_010830	TAT	2	6	1436	1441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501471
29	NC_010830	TAG	2	6	1486	1491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501471
30	NC_010830	AT	3	6	1493	1498	50 %	50 %	0 %	0 %	189501471
31	NC_010830	ATT	2	6	1542	1547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501471
32	NC_010830	TGG	2	6	1811	1816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189501471
33	NC_010830	GAT	2	6	1857	1862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501471
34	NC_010830	GAA	2	6	1899	1904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189501471
35	NC_010830	AAAAG	2	10	1908	1917	80 %	0 %	20 %	0 %	189501471
36	NC_010830	ACCA	2	8	2474	2481	50 %	0 %	0 %	50 %	189501472
37	NC_010830	ATT	2	6	2503	2508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501472
38	NC_010830	T	6	6	2511	2516	0 %	100 %	0 %	0 %	189501472
39	NC_010830	TAATCT	2	12	2518	2529	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	189501472
40	NC_010830	TTAGTT	2	12	2539	2550	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	189501472
41	NC_010830	GAAT	2	8	2582	2589	50 %	25 %	25 %	0 %	189501472
42	NC_010830	TAA	2	6	2597	2602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501472
43	NC_010830	A	7	7	2607	2613	100 %	0 %	0 %	0 %	189501472
44	NC_010830	A	6	6	2762	2767	100 %	0 %	0 %	0 %	189501473
45	NC_010830	CATTG	2	10	2807	2816	20 %	40 %	20 %	20 %	189501473
46	NC_010830	CTT	2	6	2825	2830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501473
47	NC_010830	CAA	2	6	2948	2953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189501473
48	NC_010830	AAGT	2	8	2988	2995	50 %	25 %	25 %	0 %	189501473
49	NC_010830	ACT	2	6	3008	3013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501473
50	NC_010830	AGG	2	6	3034	3039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189501473
51	NC_010830	GCA	2	6	3555	3560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501474
52	NC_010830	AGT	2	6	3562	3567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501474
53	NC_010830	ACCA	2	8	3610	3617	50 %	0 %	0 %	50 %	189501474
54	NC_010830	TTGGA	2	10	3644	3653	20 %	40 %	40 %	0 %	189501474
55	NC_010830	TAC	2	6	3671	3676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501474
56	NC_010830	TAAAGA	2	12	3793	3804	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	189501474
57	NC_010830	TAAAA	2	10	3820	3829	80 %	20 %	0 %	0 %	189501474
58	NC_010830	TGT	2	6	3884	3889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189501474
59	NC_010830	TGG	2	6	3895	3900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189501474
60	NC_010830	TA	3	6	3914	3919	50 %	50 %	0 %	0 %	189501474
61	NC_010830	CTAACA	2	12	3998	4009	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	189501474
62	NC_010830	TATT	2	8	4105	4112	25 %	75 %	0 %	0 %	189501474
63	NC_010830	ATA	2	6	4127	4132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501474
64	NC_010830	GTT	2	6	4192	4197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189501474
65	NC_010830	ACAA	2	8	4732	4739	75 %	0 %	0 %	25 %	189501475
66	NC_010830	ATT	2	6	4758	4763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501475
67	NC_010830	GT	3	6	4787	4792	0 %	50 %	50 %	0 %	189501475
68	NC_010830	GTT	2	6	4812	4817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189501475
69	NC_010830	AGC	2	6	4829	4834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501475
70	NC_010830	A	8	8	4866	4873	100 %	0 %	0 %	0 %	189501475
71	NC_010830	TGG	2	6	4961	4966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189501475
72	NC_010830	GCA	2	6	4976	4981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501475
73	NC_010830	ACT	2	6	4987	4992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501475
74	NC_010830	GCT	2	6	5004	5009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501475
75	NC_010830	AGC	2	6	5014	5019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501475
76	NC_010830	AAAAG	2	10	5024	5033	80 %	0 %	20 %	0 %	189501475
77	NC_010830	ATTAG	2	10	5037	5046	40 %	40 %	20 %	0 %	189501475
78	NC_010830	TCC	2	6	5060	5065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189501475
79	NC_010830	TAC	2	6	5100	5105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501475
80	NC_010830	AGT	2	6	5225	5230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501475
81	NC_010830	TTAC	2	8	5246	5253	25 %	50 %	0 %	25 %	189501475
82	NC_010830	TAC	2	6	5369	5374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501475
83	NC_010830	A	7	7	5455	5461	100 %	0 %	0 %	0 %	189501475
84	NC_010830	TA	3	6	5487	5492	50 %	50 %	0 %	0 %	189501475
85	NC_010830	TTA	2	6	5557	5562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501475
86	NC_010830	T	6	6	5607	5612	0 %	100 %	0 %	0 %	189501475
87	NC_010830	TA	3	6	5698	5703	50 %	50 %	0 %	0 %	189501475
88	NC_010830	T	6	6	5726	5731	0 %	100 %	0 %	0 %	189501475
89	NC_010830	AT	3	6	5854	5859	50 %	50 %	0 %	0 %	189501475
90	NC_010830	ATC	2	6	5898	5903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189501475
91	NC_010830	GTT	2	6	5940	5945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189501475
92	NC_010830	CAA	2	6	5946	5951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189501475
93	NC_010830	ATT	2	6	5976	5981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501475
94	NC_010830	AGAT	2	8	6032	6039	50 %	25 %	25 %	0 %	189501475
95	NC_010830	GAC	2	6	6116	6121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189501475
96	NC_010830	TA	3	6	7298	7303	50 %	50 %	0 %	0 %	294661088
97	NC_010830	TA	3	6	7347	7352	50 %	50 %	0 %	0 %	294661088
98	NC_010830	TAT	2	6	7821	7826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501476
99	NC_010830	TTTG	2	8	7837	7844	0 %	75 %	25 %	0 %	189501476
100	NC_010830	GA	3	6	7862	7867	50 %	0 %	50 %	0 %	189501476
101	NC_010830	ATT	2	6	7876	7881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501476
102	NC_010830	CTATC	2	10	7902	7911	20 %	40 %	0 %	40 %	189501476
103	NC_010830	TAT	2	6	7914	7919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501476
104	NC_010830	TAT	2	6	7984	7989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501476
105	NC_010830	TACT	2	8	7995	8002	25 %	50 %	0 %	25 %	189501476
106	NC_010830	ACAA	2	8	8039	8046	75 %	0 %	0 %	25 %	189501476
107	NC_010830	TA	3	6	8063	8068	50 %	50 %	0 %	0 %	189501476
108	NC_010830	TGA	2	6	8076	8081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189501476
109	NC_010830	TGC	2	6	8086	8091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501476
110	NC_010830	TC	3	6	8678	8683	0 %	50 %	0 %	50 %	189501477
111	NC_010830	AAC	2	6	8691	8696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189501477
112	NC_010830	ATT	2	6	8748	8753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501477
113	NC_010830	GGT	2	6	8825	8830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189501477
114	NC_010830	TAA	2	6	8850	8855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501477
115	NC_010830	TAT	2	6	8946	8951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189501477
116	NC_010830	TCT	2	6	9010	9015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501477
117	NC_010830	CTT	3	9	9080	9088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501477
118	NC_010830	CTT	2	6	9092	9097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501477
119	NC_010830	GCT	2	6	9103	9108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501477
120	NC_010830	TCT	2	6	9109	9114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501477
121	NC_010830	CTT	3	9	9128	9136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501477
122	NC_010830	CTG	3	9	9152	9160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501477
123	NC_010830	TTG	2	6	9162	9167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189501477
124	NC_010830	GCT	2	6	9172	9177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501477
125	NC_010830	TCT	2	6	9178	9183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501477
126	NC_010830	GCT	2	6	9184	9189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501477
127	NC_010830	CTG	3	9	9206	9214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501477
128	NC_010830	GCT	2	6	9223	9228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501477
129	NC_010830	TCT	2	6	9229	9234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189501477
130	NC_010830	GCT	2	6	9235	9240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501477
131	NC_010830	CTG	3	9	9257	9265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501477
132	NC_010830	TTG	2	6	9267	9272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189501477
133	NC_010830	GCT	2	6	9277	9282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501477
134	NC_010830	CTG	2	6	9287	9292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501477
135	NC_010830	CTG	3	9	9311	9319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501477
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139	NC_010830	CTG	2	6	9551	9556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501477
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141	NC_010830	CTG	3	9	9581	9589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501477
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265	NC_010830	AAG	2	6	16608	16613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189501482
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268	NC_010830	TAA	2	6	16813	16818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189501482
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393	NC_010830	CTG	2	6	23629	23634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189501487
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